Акадия была весьма географически изолирована, до неё трудно было добраться с материка и поблизости не было крупных портов, таких как например Квебек или Бостон. Первое французское поселение было основано Пьером Дюгуа, губернатором Акадии, под властью короля Генриха IV, на острове Сан Круа в 1604 году. Вскоре король отказал Пьеру Дюгуа в королевской пушной монополии и колонисты оказались на самообеспечении, лишённые поддержки монарха. С минимальной королевской властью, аккадийцы практиковали деревенское самоуправление.

Британские колонисты захватили Акадию в ходе войны Короля Вильгельма (1690—1697), но Британия вернула её Франции по мирному соглашению. Территория была снова захвачена англичанами в ходе войны Королевы Анны (1702—1713), и это завоевание было закреплено Утрехтским мирным договором. 23 июня 1713 года французским жителям Акадии был предоставлен срок в 1 год, чтобы объявить свою верность Британии или покинуть Новую Шотландию. При этом французы заявили о своей готовности сражаться и приступили к строительству форта. Летом 1755 года британцы атаковали форт Босэжур и сожгли дома аккадийцев в разгар Французской и Индийской войн между Британией и Францией (североамериканский театр Семилетней войны). Отказавшиеся подчиниться британской короне подверглись так называемому Великому перевороту. В течение последующих трёх лет около 6000-7000 аккадийцев были изгнаны из Новой Шотландии во Францию или простирающиеся к югу британские колонии. Остальные бежали вглубь Новой Шотландии или находившуюся под контролем Франции Канаду. Квебекский город Л’Акади (сейчас часть Сен-Жан-сюр-Ришельё) был основан бежавшими аккадийцами.

После 1764 года многие аккадийцы обосновались в Луизиане, которая была передана Испании еще до конца Французской и Индийской войн. Британия разрешила некоторым аккадийцам возвратиться в Новую Шотландию, но эти люди были вынуждены селиться небольшими группами, им не разрешалось возвращаться на места, где они проживали ранее, такие как Гранд-Прэ, Порт Рояль и Бобассан. Гонения коренных жителей Акадии упомянуты в песне Nous sommes ce que nous sommes в мюзикле «Дракула. Между любовью и смертью».